浑沌支配了大陆──人民畏惧著各种灾害。君王们手持著平息浑沌的〈圣印〉守护百姓。然而随著岁月流逝，君王们逐渐忘却了“守护苍生”的理念，为了争夺彼此的圣印和领地，掀起了一波又一波的战争……魔法师希露卡唾弃毫无风骨的各地君王，而浪迹天涯的骑士提欧则是为了解放受苛政所苦的家乡修练武艺。
一张写着「特别岛屿的招待」的传单从天而降。只要轻松讨伐怪物，就能获得100倍报酬，还能吃到限定拉面和甜点！小可爱们兴高采烈地来到了这座小岛。在岛上探险时，他们在洞窟里遇到了传说中的生物——塞壬与人鱼。看来塞壬似乎是在对岛民们复仇……伙伴们四散分离，陷入一个又一 个危机，陷入了绝境……但即便如此！大家齐心协力，一起守护这座小岛吧！
小时候搬来这个海滨城镇的由坂健次，眼里看到的，是一望无际的大海被日光照射后呈现的那一片玻子汽水般的色彩。健次在那海边同一位少女相遇。少女的名字叫做近卫七海，就住在健次新家的隔壁，窗对窗仅有1、2米伸手可及的距离。 四季转变，时光飞逝。他们两人的回忆和一起度过的岁月一起渐渐堆积。一如既往的每一天，自然而然的情感，对他们来说，这些就是如同宝物一般。日光渐渐刺眼，蝉叫依稀可辨，天空愈发湛蓝……今年的夏天也来了，对健次和七海来说平常却又有些许改变的夏天……
三年前在网络世界被奥米加兽打败的超恶魔兽重生，并不断地产生自己的婴儿期，婴儿期的超恶魔兽通过手机、电脑等入侵现实世界，在现实世界形成数码蛋，最后超恶魔兽出现在现实世界，连最强的奥米加兽被打败。。。。
快乐的暑假开始了，启人（津村真琴 配音）为了扫墓来到了风光秀丽的冲绳，在海边，他和阿海（佐伯鹏 配音）一起救下了一位名为美波（三石琴乃 配音）的少女，后者遭到了数码兽的攻击，这些数码兽的目标，似乎是美波所携带的一台笔记本电脑，在电脑里究竟隐藏了怎样的秘密？让启人感到意外的是，美波的遇险催生了数码宝贝石狮兽（津久井教生 配音）的诞生，它的使命为何？
启人发现，在风靡全球的电子宠物V-Pet背后，隐藏着一个惊人的秘密，贪婪邪恶的曼法斯兽企图通过虚拟的数码兽摧毁人类世界，实现它建立数码世界的野心。面对强大的对手，启人和朋友们该何去何从？
自人造人战士诞生以来，他们在半个多世纪中，一直守护着人们免受种种威胁和平的敌人的侵袭。 然而，战斗仍在继续—— 而如今，一支由9名人造人组成的集团“涅墨西斯”出现了，他们坚信——仅凭009他们，无法引导世界走向安宁。 由能够操控重力的改造人格拉维顿所率领的这支集团，他们所追求的“理想”究竟是什么？ 我们，是否即将亲眼见证时代的更迭？
狮堂光、龙咲海、凤凰寺风在户外教学来到东京铁塔时，突然被召唤到了异世界「塞费罗」。在那里，三人得知一直守护「塞费罗」和平与秩序的艾梅洛德公主遭人囚禁，世界正陷入危机。为了拯救「塞费罗」，被艾梅洛德公主召唤的三位少女，究竟能否成为传说中的「魔法骑士」，拯救公主与这个世界呢？
